笔者经过对《黄帝内经》相关原文解析发现，其从时间和空间两个维度应用“三阴三阳”思维模式构建了相关医药学知识。就时间维度而言，原文基于自然界一年阴阳之气的消长状态，将这一模式用于表达六节气位的阴阳属性及其次第顺序，并以此为据表达了与六位时象对应的气候属性，自此成为运气理论不可或缺的基本元素和重要内容。就空间维度而言，原文基于经脉的阴阳气血多少、分布状态，以及脏腑经脉的气机气化活动状态之异，应用“三阴三阳”思维模式完善了经脉命名和相关理论，并以此为据解释相关脏腑的生理病理，外感热病的六经病理模型就在这一背景下产生。
基于先秦“一分为三”观念建立
“《周易》的卦爻结构实际上为后世提供了一个思维模型，提供了‘一分为三’和六位时空的思维方式。这对《黄帝内经》以及《伤寒论》的理论整合和重建无疑产生了重要的影响”（钱超尘，温长路主编，《张仲景研究集成》）。《黄帝内经》据此形成的“三阴三阳”思维模式，成为构建生命科学知识体系的重要思维路径，无论是天之六节、六气，人体之脏腑经脉、外感热病的六经病理模型，都是其具体应用实例。
《黄帝内经》在先秦“一分为二”“一分为三”影响下，认为“夫自古通天者，生之本，本于阴阳……生五，其气三……此寿命之本也”（《素问·生气通天论》）；又说，“夫自古通天者，生之本，本于阴阳。其气……皆通乎天气。故其生五，其气三，三而成天，三而成地，三而成人，三而三之，合则为九，九分为九野，九野为九藏，故形藏四，神藏五，合为九藏以应之也”（《素问·六节藏象论》）。经文两次明确表达其源于先秦“一分为三”理念，为了构建的生命科学知识体系的需要，形成了“三阴三阳”思维模式的理念源头。
源于一年分四季、四季分阴阳的天文背景
《黄帝内经》之所以将一年六节时位分别用“三阴三阳”标记，完全是基于十二月太阳历法一年分为四季、四季分阴阳（又称“四象”）天文学背景。阴阳“一分为二”，即上半年为阳：春为少阳，夏为太阳；下半年为阴：秋为少阴，冬为太阴，此为“四象”。“帝曰：愿闻阴阳之三也……阳明何谓也？岐伯曰：两阳合明也。帝曰：厥阴何也？岐伯曰：两阴交尽也”（《素问·至真要大论》）。原文指出，在一年分四季的基础上，将上半年、下半年再“分之为三”。太阳、少阳两个时段的相结合处为“阳明”，即所谓“两阳合明”（明，指太阳、少阳结合处亦为阳，故为之“合明”），此即属阳的上半年“一分为三”；太阴、少阴交接之末时段，即为厥阴（厥，尽也），此即属阴的下半年之“一分为三”。《黄帝内经》也将此称为“两阳合于前，故曰阳明……两阴交尽，故曰厥阴”（《灵枢·阴阳系日月》）。
具有模糊定量特性
《黄帝内经》之所以将一年六节时位分别用“三阴三阳”标记，完全是基于不同时段阴阳之气多寡各异的模糊定量。一年四季的第一时段春季，阳气尚少，标记为少阳；第二时段夏季，阳气最盛，标记为太阳；第三时段秋季，进入阴寒之气的下半年，阴寒之气尚少，标记为少阴；第四时段冬季，阴寒之气最盛，标记为太阴。《黄帝内经》出于构建相关知识的需要，将一年“一分为三”，就是在少阳和太阳时段之间，增加被标记为阳明的时段，其阳气多于少阳，而又少于太阳；在少阴和太阴时段之末，时间恰在岁末及来年之岁首，阴寒之气最少，就增加一个被标记为厥阴的时段。显然，一年分为六时段并以“三阴三阳”标记，完全是基于对各时段阴阳之“气”多少而给予的评价、命名和模糊量化，此即“阴阳之气各有多少，故曰三阴三阳也”（《素问·天元纪大论》）之义。
同样是因为基于此特性，六步气位中的太阳被称为“三阳”，阳气最盛；阳明被称为“二阳”阳气次之，居于太阳、少阳之间；少阳被称为“一阳”，在三阳之末，阳气最少；太阴为“三阴”，阴气最盛；少阴为“二阴”，阴气次之，居于太阴、厥阴之间；厥阴为“一阴”，阴气最弱。此处分别用“一、二、三”既表达了各时段阴阳之气的多少，也模糊地表达了各时段（气位）日照时间的长短、阳光的强弱、气温的高低，以及自然界相应的象态。“象”是“三阴三阳”发生的依据，“一、二、三”之量化是模糊的，此即原文所告诫的“天地阴阳者，不以数推，以象之谓也”（《素问·五运行大论》）。这也是理解、应用“三阴三阳”思维模式的基本立场。
蕴含具象思维特性
一年六时段划分为“阴阳之三也，何谓？”这是因为各时段阴阳之“气有多少，异用”（《素问·至眞要大论》）的缘故。所谓“异用”，就是指各时段阴阳之气多寡不同，给予自然界的气候、物候，乃至人类的生理病理，产生有差异的效应、作用，以及不同的象态。如少阳春季气候特点为乍暖还寒，阳气尚少；太阳夏季阳气最盛，气候炎热；少阴秋季转入属阴的下半年，气候凉爽，但阴寒之气尚少；太阴冬季气候严寒，阴寒之气最盛。可见，一年六节时位的“三阴三阳”，是对各时段阴阳之“气有多少”所显现“异用”象态的标记，“象”是其发生的依据，说明一年六节区位的“三阴三阳”标记，有其具象思维特征。
可见，《黄帝内经》中的“三阴三阳”思维模式，源于先秦“一分为二”“一分为三”理念，深受一年分四季，四季分阴阳天文背景影响，具有模糊定量和具象思维的特征。