吴门医派在以苏州为中心的我国江南地区孕育形成，在六经辨证的基础上创立了温病学卫气营血辨证理论与临床体系，为中医治疗温病开辟了新路径。
吴门医派对温病的认识
元末明初苏州昆山名医王安道提出“温病不得混称伤寒”的论点。明代苏州东山名医吴又可在《温疫论》中指出“夫瘟疫之为病，非风非寒，非暑非湿，乃天地间别有一种异气所感。”感染途径是自口鼻而入，与现代传染病传播途径认识一致。清代名医叶天士《温热论》奠定了温病学理论框架，开温病卫气营血辨证先河。清代名医吴鞠通总结归纳叶天士之论和前人经验仿《伤寒论》体例写成《温病条辨》，更创三焦辨证方法，使温病学理论体系趋于完善。
《温病条辨》将温病分为风温、温热、温疫、温毒、冬温、湿温、暑温等，并进一步指出：“温疫者，厉气流行，多兼秽浊，家家如是，若役使然也”。其学说也与吴又可《温疫论》一脉相承。对于温病的治疗，叶天士在《温热论》中开宗明义：“温邪上受，首先犯肺，逆传心包。肺主气属卫，心主血属营。辨营卫气血虽与伤寒同，若论治法，则与伤寒大异。”强调温病初期须用“辛凉散风、甘淡驱湿”。温病特别是温疫，都具有挟湿的临床特点，叶天士指出：“且吾吴湿邪害人最广。”又云：“湿与温合，蒸郁而蒙蔽于上，清窍为之壅塞，浊邪害清也。”这些论述对于温疫初起的治疗有很好的指导作用。
中医学历来提倡上工治未病，《素问·金匮真言论》曰：“夫精者，身之本也。故藏于精者，春不病温。”对于温病的预防，吴鞠通对《内经·刺法论》评说道：“不相染者，正气存内，邪不可干，此言避瘟之道。”因此，维护正气为预防温疫的不二之法。
叶天士《温热论》说：“未传心包，邪尚在肺，肺主气，其合皮毛，故云在表。”说明肺在抵御温邪过程中起着关键的作用。温邪通过呼吸道等途径侵袭人体，首先犯肺。卫气相当于现代医学之人体免疫系统。中医藏象学说认为脾属土，肺属金，土能生金。因此在温疫的预防上要注重补脾益肺，固护卫气。
临床应用
笔者继承吴门医派创立的温病学说理论，发挥其优势，遵循中医治未病理念， 自拟吴门医派银翘防疫方（金银花10克，连翘10克，藿香10克，生黄芪10克，焦白术10克，防风6克，桔梗6克，白扁豆10克，生甘草3克），临床应用中多有效验。
本方组方来源有三：一是银翘散。银翘散为吴门医派温病第一方，方出吴鞠通《温病条辨》，具有辛凉透表、清热解毒的作用，用于温病初期邪在肺卫之卫分证。吴鞠通根据叶天士“在表初用辛凉轻剂”之论，遵从《内经》“风淫于内，治以辛凉，佐以苦甘”及“热淫于内，治以咸寒，佐以甘苦”之训，参考温病学大家喻昌“上焦如雾，升而逐之，兼以解毒”之经验，遂成此方。二是玉屏风散。玉屏风散出自宋代名医张松《究原方》，原著已失传，现存的方剂录自《医方类聚》，为益气固表的经典方。此方补中寓散，攻补益施，内外同治，标本兼顾。三是藿香正气散。藿香正气散出自宋代官修之《太平惠民和剂局方》。此方为解表化湿、理气和中的代表方，契合吴地多水湿和暑热多挟湿之机。
本方以金银花、连翘为君，辛凉透表、清热解毒兼具芳香辟秽之功，其中金银花药性甘凉，气味芳香，虽清热解毒力强，但不伤胃气，反而能护阴生津。生黄芪、焦白术、防风即玉屏风散，黄芪、白术性味甘温，内可大补脾胃之气，外可固表御邪，防风走表而祛风邪。此三药为臣，补中寓散，可增强肺之清肃功能。藿香芳香化湿，《本草正义》曰：“藿香，芳香而不嫌其猛烈，温煦而不偏于燥热，能祛除阴霾湿邪，而助脾胃正气，为湿困脾阳，怠倦无力，饮食不甘，舌苔浊垢者，最捷之药”。白扁豆健脾化湿清暑，与藿香同为佐药，清热解毒兼以化湿清暑。桔梗宣肺化痰利咽，配甘草即桔梗汤之意，桔梗又作为引经药，使药力可以直达肺经。甘草既可清热解毒，又可调和诸药。全方合用，既具清热解毒、化湿和中之功，又有益气补肺固表之力。攻补兼施，内外同治，从而发挥抗御温邪侵袭之作用。（葛惠男）