黄连为毛茛科多年生草本植物黄连、三角叶黄连或云连的根茎。性味苦、寒，归心、肝、胃、大肠经。有清热燥湿，泻火解毒之效。黄连以治火热、湿热、血热、热毒之证广为人知，但是还有一些其他作用往往为人所忽略，笔者归纳其主治作用有以下几个方面。
湿热证
本品药性苦寒，苦能燥湿，寒能泻热，对于诸多湿热证有效，而最善于清胃肠之湿热。其清热燥湿之功可用于以下三种情况。一治湿热中阻，如《伤寒论》三泻心汤证，配半夏、干姜等辛开苦降，和胃开痞，若温热蕴伏，胃肠湿热并重，霍乱吐泄者，可与厚朴、半夏等配伍，如《霍乱论》之连朴饮。二治湿热泻痢，本品为治湿热痢疾之第一要药，对痢疾杆菌、霍乱弧菌有较强的抑制作用，自古就有“古方以黄连为治痢之最”的说法，故历代均将其作为治疗痢疾的必用药。本品治痢，单用即效，亦可配伍木香，为香连丸；还可以配葛根、黄芩、甘草，为葛根芩连汤；与芍药、黄芩、大黄、木香、当归等配伍，为芍药汤，也是治痢之名方。三治湿疮，湿疮是由于湿热浸淫肌肤所致的湿疹，以本品配伍当归、赤芍、生地、黄柏、蝉蜕、苦参、荆芥等内服，或用本品与松香、海螵蛸等研细粉，制成软膏外敷，效佳。
火热证
本品为苦寒之品，其性清泄苦降，入心肝胃经，为清热泻火，解毒消肿之佳品，主清脏腑热，多用于心胃火盛，肝火上炎等。对于心火上炎者，可以本品一味煎服，如《太平惠民和剂局方》之泻心汤即是；对于热盛火炽，心神受扰的烦躁、壮热，甚至神昏谵语，常与黄芩、山栀等同用，即《外台秘要》之黄连解毒汤；如果心火盛，肾阴不足，心肾不交，出现虚烦不得眠者，则又与芍药、阿胶、鸡子黄等配伍，即《伤寒论》之黄连阿胶汤；对于心火上炎，口舌生疮，或移热于小肠，心烦尿赤，可与竹叶、栀子为伍，如《医宗金鉴》之清心导赤散。对于胃火上炎者，症见牙痛连头，面颊发热，痛处喜冷恶热，或牙宣出血，或红肿溃烂，脉滑而数，舌红苔黄，可以配当归、生地、丹皮、升麻，即《兰室秘藏》之清胃散；治胃热呕吐，常配伍半夏、竹茹、橘皮等同用，如《温热经纬》之黄连橘皮竹茹半夏汤；对于肝火上炎，常与吴茱萸同用，治疗肝郁化火之胁肋胀痛，呕吐吞酸，嗳气，如左金丸。
血热证
热毒证
本品性苦寒，清热解毒力强，现代药理研究证明其对多种致病菌有抑制作用，故为热毒壅滞皮肤诸证所常用，尤善疗疔毒。如《外科正宗》黄连救苦汤，以本品与金银花、黄芩、连翘等同用，内服之治疗疮痈肿毒、红肿疼痛，有消肿止痛之功。本品不仅内服有效，尚可外用，如《医宗金鉴》黄连膏，就是以黄连、黄柏、姜黄等配伍，制成膏药外用，配合内服药同用，效果更佳。
降血压、血糖
现代药理研究证明，黄连有一定的降压作用，作用机制与扩张血管平滑肌有关。有临床研究发现，黄连解毒汤治疗高血压伴胰岛素抵抗患者30例，连续服用1个月，结果表明，治疗组血压下降有效率达到90%。治疗心肝火旺型高血压，用黄连、钩藤、芦荟、泽泻、葛根、夏枯草、益母草、龙胆草、白芍等，降压有效率可以达到八成以上，症状改善率更高。近年来研究发现，黄连具有降血糖作用，疗效可靠。例如口服黄连素片，每次0.4克，每日3次，1～3个月为一疗程，服药后血糖下降者达80%以上，且三多一少症状明显减轻。笔者治疗糖尿病早期郁热型患者，或是胰岛素抵抗患者，习用葛根芩连汤，降糖作用明显。对于后期气阴两虚者，常与黄芪、玉竹、天花粉、人参、葛根、山萸肉、鬼箭羽等配伍，可以增加降糖效果。坚持服用1～3个月，随着时间增加，疗效也成正比提高。
除疳气
《药性论》载本品“杀小儿疳虫”，《日华子本草》云其“猪肚蒸为丸，治小儿疳气”，对于小儿疳疾，在大队健脾益胃药中加入本品，可以增强疗效，起到苦味健胃的作用。