腹泻是临床常见病，曾有门诊患者问：“大夫，我大便不成形，为什么还用黄芩、黄连？这两药那么寒，不会加重腹泻吗？”答案当然是否定的。《神农本草经》载：黄连“主热气目痛、眦伤泣出，明目，肠澼，腹痛下利，妇人阴中肿痛。”又载：黄芩“主诸热黄疸，肠澼泄利，逐水，下血闭，恶创，恒蚀火疡。”可见，古人很早以前就运用黄芩、黄连来止利，而非大便不成形即不敢用之。
第157条：伤寒，汗出解之后，胃中不和，心下痞硬，干噫食臭，胁下有水气，腹中雷鸣，下利者，生姜泻心汤主之。
第371条：热利下重者，白头翁汤主之。
第373条：下利，欲饮水者，以有热故也，白头翁汤主之。
根据条文不难看出，利遂不止、自下利、热利、腹中雷鸣下利、呕而肠鸣均与下利相关，而治疗这些病症都用到了黄芩、黄连。后世还有芍药汤、六神丸、香连丸等亦用黄芩、黄连来止利。黄芩、黄连苦寒，主要应用于热利或寒热错杂证的下利，不可用于寒证的下利。所谓热利，即腹泻的同时伴见身热烦躁、便下脓血、肛门灼热、小便短赤等热证表现，舌脉上也同样可见舌红苔黄，脉滑数等湿热征象。