牡蛎为海生介类药物，质重，其味咸涩，性凉，归肝、胆、胃三经，其重可祛怯，咸能软坚，涩可收敛，临床功可敛阴、潜阳、止汗、涩精，并有化痰软坚之成效。
潜阴冷静安神
张仲景《伤寒论》118条云：“火逆之下，因烧针烦躁者，桂枝甘草龙骨牡蛎汤主之”。方中取牡蛎用其冷静，以安烦乱之神，功在潜敛浮越之阳，宁心安神，以治烦躁。关于病实热者，热窃津液或汗流浃背，心阳随之外泄，发作惊狂，卧床不起者，取牡蛎潜阳，涤痰，镇心安神。可加龙骨与牡蛎合用重而镇怯，涩以固脱，正乃妙用也。
软坚散结利水
《伤寒论》顶用牡蛎与天花粉相伍，用于医治胁满微结与水肿病，其395条：“大病瘥后，从腰以下，有水气者，牡蛎泽泻散主之。”湿热壅滞，气化不可，则膀胱不泻，见下肢浮肿，二便晦气，脉沉实之水肿实证者，因为腰以下肿当利其小便，故治以清热逐水之法。牡蛎与泽泻、海藻同用，软坚散结利水，愈加润燥生津之天花粉，使邪气从小便而出。正如医家钱天来所说：“牡蛎咸而走肾，同渗利则下走水道”。《伤寒论》147条“胸胁满微结，小便晦气，渴而不呕，但头汗出，来往寒热，心烦”的柴胡桂枝干姜汤中，亦以牡蛎与天花粉同用，逐瘀开结，医治水饮内停所致的口渴。在小柴胡汤加减法中，见肋下痞硬，则去大枣之壅滞，加牡蛎化饮散结。医家王好右云：“牡蛎以柴胡饮之能去胁下痞也善治妇科病。
月经过多、崩漏为妇科急症，其来势猛，出血多，治之急以固摄止崩，《内经》云“阴虚阳博，谓之崩”，阳不潜藏则决堤水泛。故此证潜阳固摄尤为重要，药用牡蛎取其平肝潜阳，收敛固涩之功，如张锡纯之安冲汤，用大剂牡蛎，既有收敛止血安冲之功，又无止血留瘀之弊。
妇人带下多为脾虚水湿不运，也有湿邪内侵或肾气不固之因，但带下者多奇经损害。带脉践约，任脉不固，医治以固任束带为其准则，临证以牡蛎取其收敛固涩之功，常用炒山药、炒芡实、白果仁、鹿角霜、莲子肉等配伍。余在临证治带下病多在五味异功散基础上加牡蛎12克，效果很好。
利水固胎治妊娠病，《金匮要略》云“妊娠养胎白术散主之”。妇人妊娠后多脾虚水湿不化而有腹痛、吐逆清涎，甚则胎动不安，故多用白术健脾祛湿，方顶用牡蛎取其降逆之性，引水湿下行。清代陈修园云：“牡蛎水气所结，味咸性寒，寒以制热，咸以导龙入海。”可见牡蛎有导水湿下行而达降逆固胎之效果。保胎时也常加入牡蛎、桑寄生、杜仲、菟丝子之类。