菊花“气味苦，平，无毒。主诸风头眩肿痛，目欲脱，泪出。皮肤死肌，恶风湿痹。久服利血气，轻身耐老延年。”（《本经》）
菊花深入气血阳分，清利三焦郁火风热，所治头痛、眩晕、目疾、心胸烦热、疔疮肿毒者，皆属热邪所结之候。
《简便方》治风热头痛，菊花、生石膏、川芎等份为末，每服钱半，茶调下。风热稍重者，诸药各用15克，水煎香气大出饮之，祛风清热止痛之力甚强。桑菊饮乃《温病条辨》风温初起之轻剂，治太阴风温但咳，身不甚热，微渴者，然桑菊饮治风热感冒之轻者有效，以之治“首先犯肺，逆传心包”之风温则药力远逊。白虎汤加菊花治温病气分热盛，头痛、口渴、汗出者甚宜，更加羚羊角、大贝、生地、黄连、连翘、石决明、全蝎、蜈蚣则用于暑热疫毒之乙型脑炎，其证高烧灼身，头痛如破，烦躁呃逆，嗜睡昏迷，惊厥抽搐。
贵州陈慈煦氏有清胃潜阳方（菊花、桑叶、天麻、白芍、桑寄生、石决明、怀牛膝、钩藤、蔓荆子、石斛、夏枯草、生石膏）治高血压眩晕头痛，面部烘热，口渴心烦，脉洪大，大便结滞者。菊花清阳明胃火，厥阴肝火，又有沉降之力，平抑上亢之肝阳使之下潜。李彦师氏治高血压头目眩晕、四肢麻木者，用菊花、天麻、杜仲、生地等大队平肝熄风药，又用少量当归、羌活、附子疏通经脉，以利上逆之气血下移，是为良方。
菊花为眼科常用要药。目赤头旋，眼花面肿，因于热毒风邪上攻者，菊花（焙）、排风子（焙）、甘草（炮）各等分为散，夜卧时温水调下3钱匕（《圣济总录》菊花散）；眼目昏暗诸疾，蜀椒、甘菊花各1斤，生地15斤绞汁和匀候干蜜丸如梧子大，每服30丸（《圣济总录》夜光丸）；虚火上炎，目赤肿痛，久视昏暗，杞菊地黄丸常服之（《医级》）。至若病后双目生翳，白菊花、蝉衣等分为末，每用2钱，蜜少许，水煎服；五风内障，发病迅猛，眼珠剧痛石硬之青光眼，龙胆泻肝汤加菊花、羚羊角、钩藤、天麻；急性瞳神缩小之前期，羚羊地黄汤加菊花，皆近世眼科良医所常用之方。
然眼中翳膜，视物不明，迎风流泪等证，多肝肾阴亏，浮阳上亢为害，而饮食不节，劳倦内伤，脾虚失运，清阳不升，无以养目者复不少。当用升阳益胃汤、补中益气汤、参苓白术散加菊花数克佐之。更有眼部翳膜深沉，白睛暗赤紫胀之寒翳，乃陈寒阴气内伏传肝，只能辛温发散如《眼科奇书》大发散（麻黄、细辛、白芷、藁本、蔓荆子、川芎、老姜、羌活、防风），不可轻用苦凉之药。致若泪溢之证，多属肝虚气弱，当用养肝益肾药。
目疾繁多，热壅可用菊花清热泻火，因于寒凝气郁，痰湿瘀血者必然另用他法，总以开通玄府为要。目中玄府者，精气入目之枢纽也，或类今日眼科之血液循环系统也。
菊花苦凉能理血中热毒，生捣或沸水微煮捣绒外敷可治血热走红疔疮扩散者。《外科十法》以菊花4两，甘草4钱水煎顿服，治一般火毒疮痈初起红肿热痛者。也有用菊花、甘草各4两水煎恣意饮之治是症似更合理，甘草解毒护正，邪不可侵也。《寿世良方》以白菊花叶连根捣取自然汁1茶盅，滚酒调服，或用酒煮服，病重者宜多服。本地以鲜菊花连根捣取汁和白糖温服1碗，再用渣敷患处，均是疔疮肿毒实用良方。
菊花以开水泡服，初尝似有甘味，饮之稍久则苦味渐至沁人心脾。其虽系芳香无毒之物，因秉天地秋金肃杀之凉气，常人不可多服，虚人尤其不可久服，伤脾伤肾也。考之三焦相火，源于命门，寄于肝胆，本系真阳生气之“少火”，若其偏亢则为邪火，致阴阳失衡，善饥肥胖，阳强易举，毛发浓盛，心烦多汗，满月脸，水牛背，骨质疏松，典型者如肾上腺皮质增生症。龙胆泻肝汤加菊花清泄三焦湿热，泻其相火可以取效，因知菊花深入命门而消伐真阳也。若相火既无偏亢，亦未游离于外，升浮于上之平人，常服菊花可损及真阳。曾见多服菊花者，胃痛胸痞渐发，饮食渐少；久服菊花为茶饮者，不知觉间身冷畏寒，甚至阳痿不举，女子性欲淡漠，机体免疫抵抗调节之力因之明显削弱，百病易生也。《素问》云：“阳气者，若天与日，失其所则折寿而不彰”，此之谓也。《本经》所论久服利血气等语，必系素来肝胆湿热火旺，相火偏盛有余之人。