刘清泉对公立医院托管县级中医院模式以及中医医联体、医院管理模式进行创新，促进了北京中医医院品牌提升和顺义医院整体综合能力的快速提升，为中医医院在医改中发挥作用做出了有益的探索。
刘清泉现任首都医科大学附属北京中医医院院长、北京市中医研究所所长、北京市中药研究所所长，曾任北京中医药大学附属东直门医院急诊科主任、副院长等职。首都医科大学附属北京中医医院急诊科及ICU学术带头人，中医感染性疾病基础研究北京市重点实验室负责人。
主要研究领域是中西医结合防治突发传染病、脓毒症、耐药菌感染、多器官功能障碍综合症、心肺脑复苏、不明原因发热等内科急危重症及疑难杂症。已培养硕士生12名，指导博士生4名。主编或参与编写新世纪全国普通高等教育中医院校规划教材、卫生部“十一五”规划教材等专著12部。先后作为主要研究者承担国家自然科学基金2项、国家科技重大专项2项、国家科技重大专项1项、国家中医药行业专项1项、首都医学科技发展基金项目1项、北京市科委项目1项、北京市中医管理局项目1项。发表论文数十余篇。
兼任中华中医药学会急诊专业委员会副主委、国家中医药管理局急诊重点专科协作组组长、国家中医药管理局中医药行业科研专项专家工作组成员、卫生部突发事件卫生应急专家咨询委员会委员、中国医师协会理事、中国中西医结合学会管理专业委员会常委、中国人道救援医学委员会常委、北京市中医急诊质控中心组长、北京市中西医结合学会会长、北京市中西医结合急救专业委员会主委、北京中医药学会急诊专业委员会副主委、北京中医疑难病研究会副会长、北京中医药学会临床药学专业委员会副主委、北京中医药学会医院管理委员会主委、北京中西医结合学会理事会会长、北京医师协会中医师分会常务副会长、北京中医药学会理事会副会长、北京市食品药品安全专家委员会委员、北京中医药学会青年工作专业委员会主委等职。
刘清泉对公立医院托管县级中医院模式以及中医医联体、医院管理模式进行创新，主持起草了《北京市顺义区人民政府与首都医科大学附属北京中医医院合作共建北京中医医院顺义医院框架协议》，主持完成顺义医院的顶层设计，提出建立市、区、镇村一体化中医医联体的“大树理论”，推进建立了“北京中医医院顺义区中医医联体”，整合两院资源，推行了两院大科联合建设，推进了两院科研、教学的联合建设，促进了北京中医医院品牌提升和顺义医院整体综合能力的快速提升，为中医医院在医改中发挥作用做出了有益的探讨。
曾获全国中医药应急工作先进个人、中华中医药学会科技之星、首届中华中医药学会科技之星、首都中医药防治甲流科技攻关贡献奖、北京市十大健康卫士、第二届全国百名杰出青年中医、北京市医德楷模、北京市首届群众喜爱的中青年名中医、北京市卫生系统先进个人、北京市五四青年奖章等荣誉称号。