市面上出现不少臭氧净化空气机，一些商家宣传臭氧几乎能驱除所有的化学污染物。“臭氧化学反应的副产品是二氧化碳、氧气和水，这些都对人体无害。”其实这是一种误导。研究表明，臭氧去除室内污染物的能力非常有限。
室内环境中许多常见的化学污染物与臭氧的反应是非常缓慢的，通常持续几个月甚至几年。臭氧在降低甲醛浓度方面效果不是很好。虽然随着臭氧发生器开启时间的增长，臭氧与甲醛的反应时间也增长，对甲醛的处理效果增加，但由于室内空气流速小，臭氧与甲醛接触不充分，且臭氧释放到空气中后，因为臭氧比空气重，会沉降地面，这进一步降低了臭氧与甲醛的接触机率，从而降低了臭氧与甲醛的反应效率；另一方面，臭氧在空气中很不稳定，容易分解为其他物质。室内污染物必须在高浓度并长时间提供臭氧的情况下才能有效去除。
有一些化学污染物确实容易和臭氧反应，臭氧虽然可以降低它们中的许多成分，但反应过程中会产生醛类化合物，还会增加室内甲酸的含量，当它们达到足够浓度后，会刺激人的肺部。臭氧和一些化学物品反应产生的副产品本身非常活跃，具有刺激性和腐蚀性。
臭氧并不会除掉空气中的微粒(例如灰尘和花粉)，包括引起过敏反应的微粒物质。低浓度臭氧在用来除掉病毒、细菌、霉菌和其他生物污染物时效果并不理想，虽然会降低和抑制空气中的一些生物有机体，但是臭氧浓度必须大于标准的5～10倍，才能保证臭氧去除污染空气中的活着的微生物和抑制机体再生。
即使维持在高浓度，臭氧对生长在缝隙中的微生物(如生长在管道内层和天花板瓷砖上)也无能为力。臭氧发生器产生的臭氧只能抑制一些生物体的生长，但不能全部驱除空气中的污染物，除非浓度特别高(这样会影响到人们的健康)。
臭氧还被广泛用来进行水的消毒净化，可有效去除水中的大肠杆菌和金黄色葡萄球菌。
当人们不在室内时，用高浓度的臭氧去除特定的化学药品、生物污染或气味是可以的，但必须保证室内无人与宠物。臭氧还会影响室内植物、破坏材料等，如橡胶电线的绝缘外套，织物和艺术品的色泽。