山茱萸“味酸，平。主心下邪气寒热，温中，逐寒湿痹，去三虫。”（《本经》）
《本经》所论山茱萸，余实不能解，仅知其味酸微温，入足厥阴、少阴经。既补肝肾之阴，又能温补肾阳，涩精气，固虚脱，乃平补肝肾要药。
《小儿药证直诀》六味地黄丸本幼科补肾专药，主治幼儿肾怯失音，囟开不合，神气不足，目中白睛多，面色白光白等证，后世则以地黄丸为一切肝肾阴虚诸证之基础方，其君药虽在地黄，山茱萸补养肝肾、酸涩敛固元气，不可或缺也。
知柏地黄丸用治虚火上炎，骨蒸劳热，虚烦盗汗，腰脊酸痛；都气丸用治肾气虚乏，气喘呃逆；麦味地黄丸用治肺肾阴虚之咳嗽，喘逆，潮热盗汗；杞菊地黄丸用治肝肾阴虚之两目昏花，视物不明，或眼睛干涩，迎风流泪；左归丸滋养真阴，用治头目眩晕，腰酸腿软，遗精滑泄，自汗盗汗。所治虽不同，肝肾阴虚之病理则无异矣。
《金匮要略》肾气丸温补肾阳，所治腰痛脚软，常有冷感，少腹拘急，小便不利或小便反多，入夜尤甚，阳痿早泄，以及痰饮、水肿、消渴、脚气、转胞等病证。山茱萸补肝肾益精血，酸涩敛固以秘阳气根本，得桂枝、附子补肾阳而助气化，微微生火，成阴中求阳之方，古今适用也。《济生》肾气丸治腰重脚肿，小便不利；十补丸治肾气不足，面色黧黑，足冷足肿，耳鸣耳聋，足膝软弱，腰脊疼痛；右归丸补肾阳而填精补血，用治久病气衰神疲，畏寒肢冷，阳衰无力，下肢浮肿，腰膝软弱，均肾气丸衍生而成，皆能温补肾阳也。
张锡纯曰：“凡人元气之脱，皆脱在肝。故人虚极者，其肝风必先动，即元气欲脱之兆也......萸肉既能敛汗，又善补肝，是以肝虚极而元气将脱者，服之最效。”所订升陷汤本治胸中大气下陷，气促急短，呼吸困难，脉沉迟微弱或参伍不调者。若病重将脱，不用参附而用大剂量净萸肉收敛欲散之正气以救危，必有大量临床实践之基础。
贵州王希仲氏有固元四逆汤（生附子12克，干姜、炙甘草各10克，净萸肉30克，急煎频服）治少阴病四肢厥逆，恶寒蜷卧，呕吐不渴，腹痛下利，神衰欲寐，舌淡紫暗，脉微欲绝，病见多种休克垂危者。又有参附山萸肉汤（白人参12～30克，熟附子10～30克，净萸肉15～45克，急煎频服）用治色脱。所谓色脱者，乃因同房时男性心火暴张，精液倾泄不止而元气暴脱。重者可见神志昏迷，大汗淋漓，面色苍白，四肢厥冷，脉微欲绝。山萸肉酸温不仅能收敛固护欲脱之元精与元神，且收涩中又有条达之性，并不敛邪，故通利九窍，流畅血脉，元气将脱者服之甚宜。余认为：补中益气汤本治气虚发热，久泻久利，脱肛，子宫下垂诸清阳下陷类证；玉屏风散本治表虚自汗，易感风邪；生脉散本治夏日耗气伤津，体倦汗多，咽干口渴；举元煎本治气虚下陷，血崩血脱，亡阳垂危；圣愈汤本治月经先期，量多色淡，四肢乏力，体倦神衰；八珍汤本治失血过多，面色苍白或萎黄，头晕眼花，四肢倦怠，气短懒言，心悸怔忡；固精丸本治遗精滑泄，神疲乏力，腰酸耳鸣；二仙丹本治男子遗精白浊，女子带下稀白；缩泉丸本治下元虚冷，幼儿遗尿；固本止崩汤本治妇人一时血崩，两目黑暗，昏晕在地，不省人事。若能视病情轻重缓急，适加山萸肉，各方补气养血、回阳救逆、补虚固脱、生津止渴、调营养卫之功无不有增也。