丹参“味苦，微寒，无毒，主心腹邪气，肠鸣幽幽如走水，寒热积聚；破症除瘕，止烦满，益气。”（《本经》）。
心腹邪气，肠鸣幽幽如走水等病，是因瘀血内停而化为水，再因瘀血阻滞气机，所以肠鸣幽幽，丹参祛瘀血而生心血，故能治疗此类病症。
丹参为妇科常用药，能活血祛瘀而不伤正，同时也能补血，故有“一味丹参散，功同四物汤”之说，补血生血，功过当归、熟地，调血敛血，力堪芍药，逐瘀生新，性倍川芎，临床常用于治疗各种因瘀血内停、血运不畅导致的妇科病。
月经不调、血滞经闭、痛经、崩中漏下等月经病，均可配伍丹参。对于月经量少、月经周期不准、闭经患者，经净后常配伍熟地、山药、山茱萸、当归、白芍补肾益精养血，经行时常配伍四物汤、泽兰、益母草活血调经。但于崩漏应用时应斟酌用量，只有当血块多时才能用少量丹参，否则不但血不止，还会加重病情。临床用少腹逐瘀汤加失笑散、丹参治疗寒凝血瘀型痛经，能活血不伤正，祛瘀而生新，效果极佳。
丹参治疗宫外孕也十分有效，宫外孕Ⅰ号方、宫外孕Ⅱ号方即用丹参、赤芍、桃仁活血祛瘀，配伍三棱、莪术消癥散结。孕妇慎用丹参，容易活血太过而流产。
产后恶露不尽，色紫黯，有血块，腹痛拒按者，为瘀血停滞胞宫，余常用生化汤配伍丹参、益母草、炙黄芪活血化瘀兼以扶正。
癥瘕、盆腔炎、不孕症等妇科杂病也可用丹参，旨在活血通络、止痛消癥。
丹参不仅可以破宿血而生新血，还有很好的止痛作用，常与其他活血止痛药如当归、乳香、没药等同用，余常用活络效灵丹加减治疗各种跌打损伤，效果显著。丹参归心、肝经，故胸痹心痛、胁肋疼痛、脘腹胀痛等气滞血瘀之证也常用丹参。
丹参性偏凉，又能活血，故有很好的凉血消肿作用，余常用丹参配伍清热解毒药如银花、地丁等治疗外科痈肿、疮疡；
丹参归心经，是一味很好的治疗心脏血管疾病的中药。心藏神而主血，心火太动则神不安，丹参性凉、入血分，能清血中之火，故能止烦满而安神，余常配伍远志、柏子仁、酸枣仁治疗心神不安之证如心悸、怔忡，效果显著。丹参可以扩张冠状动脉，改善心肌缺血症状，故对于冠状动脉粥样硬化性心脏病、心肌缺血、心绞痛的疗效也很显著。丹参能使主动脉粥样斑块形成面积减少，血清总胆固醇和甘油三酯降低，故临床可用于降血脂，余常与三七同用，效果显著。