藿香正气液是家庭常用的药物，在使用时须注意以下事项。
藿香正气液不宜与一些药物同服：主要是头孢类药物，还有甲硝唑、磺酰脲类的降糖药和磺胺类药物等。如果同时服用或间隔时间较短，可能会出现面部潮红、血压降低、心跳加快等情况，严重的甚至会心动过速、休克。一般来说，间隔时间最好在3—5天，如果是输液类用药剂量较大，或年老体弱、过敏性体质等方面的情况，最好等到10天以上。
另外，服用藿香正气液的过程中，别吃辛辣、刺激性的食物，也别同时吃滋补性的中药。有些老年人有长期服用人参等滋补性中药的习惯，但喝藿香正气液时就该停掉，因为会影响滋补药的吸收。同时，感冒期间也不宜服用人参等滋补药。