仲景六元辨证所要辨明的，就是人与自然五运六气三阴三阳相通产生的六大系统疾病，预测其间甚时、欲解时等，然后借助自然之天功或者药、针等，干预疾病诊疗康复全过程。
三阴三阳病皆有间甚时、欲解时。如仲景明确指出了六病欲解时：太阳病欲解时，从巳至未上。阳明病欲解时，从申至戌上。少阳病欲解时，从寅至辰上。太阴病欲解时，从亥至丑上。少阴病欲解时，从子至寅上。厥阴病欲解时，从丑至卯上。
要想弄明白这个问题，首先要通晓五运阴阳学说通晓人与自然的整体恒动规律。因为按五运阴阳学说，人与自然相应相参。而相应相参要靠人体三阴三阳，即十二经脏营卫血气系统。
天有五运六气三阴三阳，人也有六脏（五脏加心包络）六腑六元系统；天以六六为节，人有六元系统为制。《内经》认为，随着时、日、月、季、年甚至甲子之所加，人和生物都会产生节律性、周期性、恒动性的运动变化。
在一年中，五运六气分六步莅临地球，形成六个运气节段。仲景明确指出了三阴三阳主客六气的运变：厥阴生少阴，少阴生少阳，少阳生太阴，太阴生阳明，阳明生太阳，太阳复生厥阴，周而复始，久久不变，年复一年，此名主气。
厥阴生少阴，少阴生太阴，太阴生少阳，少阳生阳明，阳明生太阳，复生厥阴，周而复始，此名客气。
初气始于大寒，二气始于春分，三气始于小满，四气始于大暑，五气始于秋分，终气始于小雪，仍终于大寒，主客相同，其差各三十度。（《桂林古本伤寒杂病论·六气主客》。）这就是人与自然的整体恒动规律。
而按《内经》，一日也可分为四时。一日其实是一年的缩小版。十二时相当于十二月。天之三阴三阳，人之十二经藏六元、营卫血气系统，无时不在进行着整体的、恒动的、节律性、周期性的运动变化。中医的子午流注便创生于此。
子午流注根据十二经脉血气旺衰，借自然之天功依据时辰选穴疗疾，常常立起沉疴。而仲景六病欲解时则说的是一日之中主客六气的变化。
通过学习我们知道，子午之年，少阴君火司天；丑未之年，太阴湿土司天；寅申之年，少阳相火司天；卯酉之年，阳明燥金司天；辰戌之年，太阳寒水司天；巳亥之年，厥阴风木司天。一日之中也是这样。
如太阳病欲解时是巳至未上。首先我们了解到，太阳病的病因是寒水，而按《内经》人日节律，巳时厥阴风木司令，风能胜湿，寒水有解冻之机。午时少阴君火司令，寒水之邪暂时退避。未时太阴湿土司令，土克水，寒水之邪式微。
阳明病，申时少阳相火司令，火克金，阳明之邪暂退；酉时阳明本气自旺，可与邪争；戌时太阳寒水司令，燥金之邪必有缓殆。
少阳病，寅时少阳本气自旺；卯时阳明燥金司令，火不能克；辰时太阳寒水司令，水克火，病有向愈之机。
太阴病，亥时厥阴风木司令，风胜湿，邪有松动之机；子时少阴君火司令，火生土；丑时太阴自气旺盛，皆有欲解时机。
少阴病，子时君火自旺；丑时太阴湿土司令，中土万物所归，中土安则邪不得复传；寅时少阳相火司令，相火以位，臣来勤王，君火有自安之势。
厥阴病，丑时太阴湿土司令，脾家实，肝木不得乘克；寅时少阳相火司令，相火以位，诸邪退避；卯时阳明燥金司令，金克木，病有欲解时机。
明白了六病欲解时，那么我们对内经伤寒一日太阳，二日阳明等等也会明了了。原来，不是伤寒日传一经，而是日转一气。所有疾病都会随着时空变化而有相应变化。
比如，甲辰日，气运以寒湿为主，中运太宫土运，那么明日一定是乙巳日，变成了风热气运为主，中运金运不及的日子了，按祖先干支纪年、纪日的六十甲子环周表三日干支丙午，变成了热燥气运为主，而中运水运太过，克制君火相火，寒热往来，少阳之证乃成。四日丁未，湿寒气运为主，中运木运不及，湿淫水变，太阴病作。五日戊申，少阳司天，厥阴在泉，中运火运太过，风火相扇，入通少阴，厥阴代心肾受邪，或从本热热化，或从标阴寒化，或夹杂而为少阴诸证。六日乙酉，阳明司天，少阴在泉，中运金运不及，燥热无制，厥阴包络肝脏受邪，从乎中见少阳火化，风火相扇，食气散气，为寒为热，错杂纷呈而为厥阴病。
如果说生物全息律研究让人们知道了一个细胞可含有整体全部信息的话，那么《内经》创立的五运阴阳学说告诉我们，人和自然都有自己的全息律。五运六气三阴三阳决定了人与自然的整体恒动。人体三阴三阳十二经脏、营卫血气系统的生理病理变化，与大自然三阴三阳变化保持着神奇的一致性。仲景六病欲解时和《内经》伤寒日传一经论断的揭示，充分说明了通晓五运阴阳学说的重要性。五运阴阳学说就是古代科学之科学，是我们现代人亟待弄明、吃透，传播与大众，造福全人类的认识论和方法论。