中医学是整体医学而不是局部医学，是动态医学而不是静态医学，是功能态医学而不是形态（解剖）医学，因而有着自身独特的诊治及预防疾病的原理。
中医诊断疾病的基本原理
诊断就是诊察了解、分析判断的过程。医学诊断是医生的认知活动过程。不同的医学诊断活动，有着各自不同的诊断依据、原理和方法。
（一）中医认识疾病发展的基本理论模型
1．“邪正相争”——最基本的病变发展演变规律
正常人体，“正气存内，邪不可干”。病变之时，“邪之所凑，其气必虚”。正气是一切抗病因子和因素的总和，邪气是一切致病因子和因素的概称。
“邪正相争”导致出现“邪正盛衰”的变化，随着这种变化，可出现：正胜邪退，则病愈，或病情渐轻，向愈；邪盛正衰，则病重，或病情渐重，恶化。
2．阴阳失调——常人变为病人的关键
正常之人，“阴平阳秘，精神乃治”。病变之时，人的阴阳失衡而出现阴阳盛衰，阳盛则阴病，阴盛则阳病；阳盛则热，阴盛则寒；阳虚则寒，阴虚则热。
3．气机逆乱——病变之人气机（功能）运行的状态及其规律
正常人体，气机的升降出入正常有序，升清降浊，气血条畅，五脏六腑通泰，四肢百骸得养，内外整体和谐，使得“阴平阳秘”而“正气存内，邪不可干”。病变之时，气机的升降出入紊乱甚而逆乱，清者不升、浊者不降，“毒”邪内积；五脏六腑不调，四肢百骸失养，内外整体不和，则病变由生。
（二）中医诊病的基本原理与方法
1．以人体“藏于内,现于外”的“藏象”为依据和信息源
中医诊察了解疾病，可以不打开人体，不依赖解剖学知识和现代仪器，仅用望、闻、问、切“四诊”，靠医者的感觉器官，就能从人体外部获知人体内部变化的信息，进而查知其内部变化。
中医应用望、闻、问、切方法收集到的信息，就是从整体入手，收集和辨别人“藏于内,现于外”的“藏象”信息。如是，“藏象”就成为中医诊察了解、分析疾病的最基本的信息依据和来源。
2．“藏象”是人整体生命活动的具体反应信息
中医理论认为“藏于内之脏,必有形于外之象”,“有诸内,必形诸外”。因此，通过察外现之“象”，即可知内在之“藏”的变化。其原因和依据在于：
其一，人体以居于内的“五脏”为中心，通过经络，内连六腑、奇恒之腑，外连经脉、骨肉、皮毛，形成一个互为表里、如环无端、阴阳互根、气血流畅、内外互通的有机整体。
其二，人与外界的自然环境、社会环境息息相关，内外互通。人体内外联系互动的生命活动过程，也是人体功能活动的过程，产生着大量的信息，发生着交流运动，形成生命活体的“功能态”信息而表现于外，从人体外可征可知。
其三，对“藏于内”而“现于外”的生命活体的“功能态”信息进行辨别分析的方法，蕴含和运用了现代控制论的“黑箱”理论原理。
3．察“象”知“藏”是中医诊病的根本途径
中医学对人体的认识不以解剖学的还原分析为主，而是以整体综合性地收集分析“藏于内、象于外”,“有诸内、必形诸外”的“藏象”为依据。
察外现之“象”而知内在之“藏”，就是通过分辨“藏于内、形于外”的人体“功能态”信息，诊病变化。依据分辨“功能态”信息诊病，其实质就是应用“生物信息学”原理诊病。
4．“以常衡变”是中医诊病的基本标准与参照方式
中医学认为，万事万物均由“阴阳”构成，均有“常”与“变”。天、地、人、事之“常”即为“阴平阳秘”，天、地、人、事之“变”即是“阴阳失衡”，或“阴盛阳衰”，或“阳盛阴衰”，甚则“阴阳离绝”。因此，以“阴平阳秘”所形成之“常”，衡量评价评判“阴阳失衡”所致之“变”，即为中医诊病的基本标准与参照方式。
“常”，即为常规、常理、常识、常量，具有相对性与广泛性。
“变”，即为变化、改变、异常。细细分辨，又有“常中之变”与“异常之变”的不同。
5．“司外揣内”与“见微知著”是中医诊病的基本方式
中医根据“有诸内，必形诸外”的藏象依据，通过察“象”知“藏”的根本途径，依据外在的“象”，综合分析推知揣测内在之“藏”的生理病理变化。
“司外”，就是紧紧地全面地抓住并分析人体内在之“藏”表现于外的“象”；“揣内”，就是依据外在之“象”，全面分析推知揣测内在之“藏”的状况。
“见微知著”蕴涵着“生物全息”的原理，揭示和反映出中医诊病整体分析的内在联系。中医认为，整体变化源于局部的变化，局部可显整体。这蕴涵着“生物全息”的原理。如：全身的气血、经气的运行，可在某一些特定局部反映出来。如：脉象、舌象等。
6．整体诊察与望、闻、问、切四诊合参
在整体观的指导下，中医既把握住人的整体联系，又注意分部位诊察，以全面收集病情资料；既分别运用望、闻、问、切四种诊法诊察病情，又强调将望、闻、问、切四诊的认识合参，印证、校验其真实性和有效性，以确保诊察结论的可靠性和全面性。