徐经世教授在治疗脾胃病方面提倡“补脾土宗东垣，理脾阴崇吴澄，养胃阴效天士”，主张在滋补脾阴时应佐以补气行气之品，使其补而不滞，进一步完善了脾胃学说。
随着人们生活水平的提高，在日常生活中，饮食膏粱厚味者居多，每每伤及人体的脾胃运化功能，从而引发湿邪内生或气滞血瘀。因此，临证多见湿浊内停，蕴而化热者或气血瘀阻，伤及胃阴者。徐经世教授重视脾阴不足之证，认为脾阴不足并不单纯是脾脏本身功能失调所致，而又受肝肾阴虚和阳明及肺经燥热所导致。肝肾阴虚，大多见于生活有失调摄，劳心竭虑，致伤于肝，郁而不达，肝气不疏，久而致肝肾阴虚，阴虚生内热，伤及于脾，耗伤津液，引起脾阴亏虚。还有胃腑燥热，消灼阴津，累及于脾，而形成脾胃不足。或是肺金化燥，伤及肺津，肺阴亏损，子病及母，耗损脾阴，日久后形成脾阴虚证。治疗上，如因肝肾阴虚引起的脾阴不足者，大多选择二至丸、一贯煎养益肝肾，滋养条达；如因胃腑燥热者，治疗上要养益胃津、清热润燥为主，加上北沙参、麦冬来滋补脾阴；因肺燥伤阴所及者，润肺清金以减脾阴之耗。
徐经世教授提出调理脾胃“三原则”，即“护脾而不碍脾，补脾而不滞脾，泄脾而不耗脾”；他也提出调理脾胃“四要素”，即“补不得峻补，温燥要适度，益脾重理气，养胃用甘平”。他还提出在脾胃病治疗方面有三忌三宜，“一是忌峻补，二忌温燥，三忌滋腻”，就是要“宜补而不滞，宜温而不燥，宜滋而不腻”，最重要的是掌握一个“度”。
徐经世教授强调，处方遣药要求把握九个方面的要诀：一是要因人、因地、因时而异；二是精准剂量配伍；三是慎防克伐太过；四是注重双向调节；五是治脾不忘调肝；六是重视情志调摄；七是纠偏不能过极；八是时刻顾护脾胃；九是常以平和取效。
徐经世教授在用药方面有以下法则。一是在临证调治细加揣度，权衡利弊。选药应消中有补，散中带收，补而不滞；二是临证用药，辨证应该精准，药不在多贵在精，药少力要专；三是选药时应考虑到一药多性，一药多用；四是临证处方不要墨守成规，应师前人之法，而不泥前人之方；五是一方治多病，选药需要斟酌，用量应当细酌，既要到位，又不能太过，要配合得当，君臣佐使结构缜密；六是辨证论治时，首先要抓住病机，切勿操之过急，只要辨证无误，治疗正确得当，方药定会切中病机；七是组方用药应恰到好处，既遵法度，又参药理；八是老年人如用药味重，则很难受纳，更有伤于胃，所以要用药取效，首先要使胃能受纳；九是首用平和之剂，既能治疗疾病，又不伤及本体，不仅是表现在药味少，药量轻，还有更深的层次。
徐经世教授处方用药的特点有五个方面：一是取药清灵，性味平和；二是巧用中药，恰到好处；三是善用药对，配伍精当；四是遣方有道，药少力专；五是妙用成方，重在变通。