云南是民族文化和绿色生物富集之地，明代的兰茂医家风骨铭刻了云南中医药文化的历史印迹。云南集兰茂以及曲焕章、吴佩衡、戴丽三、姚贞白、康诚之等名医大家遗风，续写了近代的中医药文化。
新中国成立后，云南有关部门一手抓中医药医教研，一手抓中医药文化建设，中医药文化不断深入人心。改革开放以来，云南中医药文化建设进入新的发展时期，特别是2009年全国启动的“中医中药中国行”活动，云南紧扣“传承中医国粹，传播优秀文化，共享健康和谐”的主题，举办了内容丰富、形式多样、特色鲜明的活动，对推动云南中医药事业的发展产生了深远影响。据不完全统计，中医药文化科普直接服务群众30万人次。
2010年至今，“中医中药中国行·文化科普宣传周”活动先后在昆明、嵩明、安宁、德宏州芒市等主会场地集中启动，全省各地州分会场陆续开展各具特色中医药文化科普活动。现场发放《中医适宜技术手册》、中医药科普知识宣传资料；“百米展廊”向公众展示中国古代医药发展史、食疗药膳漫画以及云南中医药和民族医药发展现状；举行中医药文化知识现场互动活动，开展中药谜语及互动游戏；发放回收《中医药民众认知度调查调查问卷调查表》；在社区表演中医药传统保健功法及保健操，举行培训讲座；云南中医学院组织举办“兰茂之声”中医药论坛和专题学术讲座等等。全省16州市、县级中医医院开展了专家门诊义诊咨询，免收挂号费及诊查费。省中医局分批组织中医药科普专家巡讲团赴大理市、红河州、临沧市、陆良县、梁河县、盈江县、陇川县、文山州、普洱市、瑞丽市开展中医药文化科普知识巡回讲座、专家义诊等。
总结近10年的中医药文化建设，主要有以下三点经验：
抓中医药知识和法律法规普及。开展《云南省发展中医药条例》知识竞赛，全省16州市和省直单位共17支代表队参加了总决赛。知识竞赛的开展，掀起了全卫生系统学习宣传《条例》的热潮。
抓医疗机构中医药文化建设。全省各级中医院在搞基础设施建设的同时，建设富有中医文化气息的医院房屋、庭院和中医药文化长廊。云南省中医医院、楚雄州彝医医院、版纳傣医医院、迪庆藏医医院、玉溪市中医院等三甲医院充分将中医药文化与民族文化结合，从标识、环境、制度等文化都浸透着中医药人文精神，为患者营造人文关怀，为员工提供精神动力，为发展增强软实力。部分乡镇卫生院和村卫生室充分利用壁画、墙报和在室内外张贴宣传画图等普及中医药知识，以保山腾冲县固东镇中心卫生院为代表的一批乡镇卫生院建成了富有文化气息的中医馆和中草药植物园。中医药文化已经扎根基层，与老百姓拉近距离。
抓大学校园文化建设和中医药文化核心价值观培育。云南中医学院呈贡校区建成“秦砖汉瓦、汉唐风格、天圆地方”具有浓郁传统文化特征的校园，校园内陆续将建设中医药名人、名方、名药园，融合花园、药园、公园、校园一体的人文精神与医道精神和谐统一的魅力高校。通过课堂及教学实践将中医药文化核心价值观渗透于医学生的思想和灵魂深处，培养仁爱术精的大医。
“中医中药中国行”是中医药文化之旅、科普之旅和惠及百姓、服务大众的健康之旅。云南的中医药文化建设将促进各级中医医疗机构树立良好的医德医风，培养可靠合格中医药优秀人才，推进卫生健康事业的和谐发展。
云南省中医药民族医药博物馆于2011年建成，是目前云南省唯一的省级传统医药博物馆，也是云南省科普教育基地和中医药文化宣传教育基地。
走进坐落在云南中医学院内的博物馆，秦汉时期的建筑特征加上颇具傣族庭院风格，给人厚重而又不失飘逸，棱角分明却也和谐相生的感觉。据说此建筑曾获得首届“云南卡瓦格博优秀建筑创作”奖。
博物馆总建筑面积4600多平方米，分为共3层，有12个展厅，每层4个，一楼为中医药历史文化展厅、中医西传展厅和云南中医学院院史馆；二楼为云南民族医药展厅（云南民族医药历史文化、特色诊疗、成果和民族药标准展厅）；三楼为中药标本展厅（《滇南本草》展厅、《神农本草经》展厅、传统药材展厅和云南特色药材展厅）。同时，在依托实体博物馆的基础和资源上，基本完成了博物馆的网络建设，一期7个展厅的建设对外开放，二期建设将在2015年完成全部工作。
博物馆以云南地产中药资源和民族医药为特色，馆藏有中药标本2000余种，民族药标本1000余种；中医药、民族医药文献古籍60余部、文物实物200多件。展示了云南中医药和民族医药悠久的历史，反映了中医药、民族医药从形成发展到继承到创新的轨迹，是博大精深的中医药和民族医药文化的缩影。
民族医药是云南省中医药民族医药博物馆最具特色的展示。云南有25个少数民族，彝族是云南分布最广、最多的少数民族，傣族、白族、纳西族等15个民族是云南独有的民族，同时云南有着独特的地域环境、地理地貌和立体气候，铸就了“植物王国、动物王国、金属王国”三顶桂冠，是中国乃至世界自然与人文最具多样性的传奇之地。得天独厚的天然药物资源，是云南民族医药和文化形成的摇篮。
云南民族医药大体可以分为三种类型，一是民族医药理论体系相对完整，有医学典籍和相当丰富的长期实践经验，也有比较完整的历史记载，如傣医药、藏医药、彝医药等；二是一定的理论基础和丰富的临床实践经验，历史上也积累了一些经典著作，但受社会经济发展水平限制，医药理论体系还不完整，但特色鲜明，如白族医药、壮族医药、瑶族医药、苗族医药、纳西族医药；三是由于各种原因，目前尚未形成完整的理论体系，仅有基本经验，没有文字记载，主要通过口授心传保留下来的民族医药，如景颇族医药、拉祜族医药、基诺族医药、独龙族医药、傈僳族医药。云南民族医药文化的多样性，为博物馆的展示提供极好的素材，博物馆也承担着对于这些优秀的民族文化的保护和传承的重任。
在云南民族医药中，以傣族和彝族最具代表性。傣族医药是我国四大民族医药之一，是云南独有的民族医学，它与泰国的泰医学一脉相承，馆内供奉着傣、泰两个民族共同尊崇的医学始祖——龚麻腊别。傣医学以四塔五蕴理论为核心理论，以嘎雅山哈雅（人体解说）、雅解理论、风病论、三盘学说为特色理论，以摸脉、甲诊、数理诊断为特色诊法，有烘雅（熏蒸疗法）、烘雅（熏蒸疗法）、打雅（擦药疗法）、阿雅（洗药疗法）、难雅（坐药疗法）、沙雅（刺药疗法）、果雅（包药疗法）、过（拔罐疗法）、闭（推拿按摩疗法）、锤筋疗法、红犁踏踩疗法等十多项传统特色疗法。博物馆对于傣医学的发展历程、理论体系、特色疗法、方药、传承等方面进行了详细的展示，主要展示傣医历史名医（龚麻腊别、八大名医和八大要方）、傣医古籍（贝叶经44册、纸板经22册）、经典著作的译著《嘎牙山哈雅》（《人体解说》）、《帷苏提玛嘎》（《清净道论》）、《挡哈雅龙》 （《大医药书》）、《嘎比迪沙迪巴尼》（《诊治书》）、反映傣医学理论体系的图画和书籍、傣药制药工具（古称、磨药工具、晒药工具等）和名药的实物（雅解沙把（百解胶囊）、雅解匹勒（妇安解毒丸）、雅西里勐腊嘎罕（万应美颜胶囊）、雅叫哈顿（五宝药散）、雅叫帕中补（亚洲宝药丸））等，同时设有傣医药特色诊疗的体验区。
彝族，是云南省人口第一大少数民族，因创造了名扬世界的“彝族十月太阳历”而被称为“太阳民族”。彝族医药历史源远流长，其发展历史可追溯到5000年前，即原始社会时期，彝族的医药就已萌芽，彝医药发源于南诏大理医药学，同时吸收了中医学、印度医学和波斯医学的精华。彝族医药理论主要由“三气”理论、“哎哺”学说、五行学说、二气六路学说，彝医以用酒作药为特色。博物馆对这些内容都进行了详细的展示，藏有毕摩经译著全套、彝族古籍译著（《医药好药书》《医病书》等）、彝族医药的现代文献和药材。
特别值得一提的是，在博物馆云南民族药标准展厅展示了云南省境内少数民族习用的近400种药材，其中部分是《云南省中药材标准》彝药、傣药的标准药材。另外，博物馆对于藏族、纳西族、苗族、瑶族等云南其他少数民族也进行了详细的展示。