《伤寒论》在我国中医药学术史上是一部具有辉煌成就的中医经典著作。它继《内经》、《难经》等医学理论著作之后，创立了六经辨证论治理论体系，将理法方药融为一体，揭示出疾病的辨证论治规律，为后世临床医学奠定了坚实的基础，具有很高的科学水平和实用价值，对中医药学的发展产生了深远的影响。《伤寒论》是中医学的主体内容，一直指导着中医学的各个学科，是中医界深入学习，执着探索与潜心研究的主题。纵观中医学的发展，《伤寒论》是其中最丰富的内容之一，亦是中医领域里研究最活跃的学科。历经1800多年的实践研究，《伤寒论》得到不断的充实与发展，突出了《伤寒论》的重大成就与实用价值，更彰显出《伤寒论》长盛不衰的生命活力。
研究《伤寒论》水平的提高与发展，很大程度上反映了当代中医学术水平。因此，研究《伤寒论》，弘扬仲景学说，是当前首要课题，任重道远。《伤寒论》学术体系的理论核心内容分为三大主干线，一为六经辨证论治理论体系；二为理法方药运用规律；三为开奠临床医学基础。
六经辨证理论体系
1．承传前人医学成就
张仲景系统总结秦汉以前的医学成就，发展了《内经》、《难经》、《神农本草经》、《汤液经法》等经典中医理论，并将理论与临床实践相结合，完成我国第一部理法方药完备的经典医籍《伤寒杂病论》（后分为《伤寒论》与《金匮要略》），对中医药学发展作出了重大的贡献，对世界医学的发展也有着深远的影响。
2．创立辨证理论体系
《伤寒论》创立了独特的六经辨证理论体系，张仲景在《素问·热论》六经分证的理论基础上，创造性地把外感热病错综复杂的证候表现及其演变规律加以总结，分析归纳，创立了六经辨证理论体系，为外感热病的论治建立辨证规律和纲领。《伤寒论》创立了六经辨证理论体系，同时与脏腑辨证、经络辨证、八纲辨证、病因辨证、营卫气血及三焦辨证等多种不同的辨证方法，为中医学理论体系与临床医学的发展，奠定下坚实的基础。
3．确立“辨证论治”法则
《伤寒论》这部中医经典巨著，构成了仲景学说的主体，仲景将《内经》的阴阳学说、脏腑学说，以及病因病机、诊断方法、治疗法则等学术理论有机地联系在一起，并根据六淫、内伤等三因为病的病理变化，判明病位所在、病性所属、病势进退、正邪盛衰、预后吉凶等，提出科学实用的辨证方法和治疗措施，确立辨证论治的原则，成为中医学理论的核心内容。“辨证论治”是中医学独有的学术特色和优势，为后世临床医学的发展奠定了基础，故前贤赞曰“辨证论治是伟大的发明”，这正是张仲景对中医学的一大贡献。
理法方药运用规律
1．确立理法方药基础理论与运用规律
《伤寒论》以辨证论治理、法、方、药一线贯通著称，而“辨证论治”必在六经辨证理论指导下，掌握理法方药运用规律。论其辨证，是以辨别阴阳表里、寒热虚实、营卫气血、真假证候、主证兼证，从而判明脏腑经络病变所在及其相互转化，这充分体现了辨证的对立统一法则与整体观、恒动观的特长。论其施治，必在辨证前提下，因证立法，因法定方，因方选药，严守法度，选用汗、吐、下、和、温、清、消、补的治则与治法，为外感热病及内伤杂病，确立了科学实用的论治措施，使理论与实践紧密结合，树立了理法方药一贯性的学术体系，为后世学习与临床掌握辨证论治理论与理、法、方、药运用规律树立了圭臬。
2．承创研制效验名方
《伤寒论》创载了诸多经典方剂。《伤寒论》之方，选药精当，组方严谨，应用得当，疗效甚佳，故称为“经方”。经方概括为三大特长。
（1）经方为母，化裁多端：经方为“医方之祖”，后世医家赞《伤寒论》为“活人之书”、“方书之祖”；誉仲景为“医圣”。如晋代医家皇甫谧称仲景之论“用之多验”，唐代孙思邈曰：“江南诸师秘仲景要方不传。”说明仲景医术的高明及其效验，引起历代世医的高度重视和珍爱。如清代陈修园曰：“经方愈读愈有味，愈用愈神奇”。可见经方的效力之大，影响之深，受益之广。总结了前人经验，发挥特长，有所创见，是后世“医方之源”，更是后世“医方之母”。突显经方承前启后之圣功，更加丰富了方剂学内容，扩大了经方应用范围，故宋之大医成无己称赞经方“最为医方之祖”。
(2)经方之长，效价佳良：经方的效价可概括为：“普、简、廉、效”，正是张仲景组方用药的四大特点，即采用经济实惠、效果佳优的常用药品，以精简的药味，科学的方法，组成方剂，用于治疗外感病与杂病。仲景之方，精明简练，学之有规，用之有矩，融会贯通，则收桴鼓之效。仅就现代经方用于治疗与研究来看，其研究领域之宽，应用范围之广，适应病证之多，治疗效果之佳，均有长足的发展。经方广泛用于治疗临床各种疑难杂病，经久不衰，效价优良。
（3）首立合方，创新法则：张仲景首创“合方”之用，记载于《伤寒论》第23、25、27条原文。“合方”之词，始见于林亿等校注《伤寒论》的按语中。从此“合方”法则便应用于临床，发挥其独特的优势。仲景合方论治堪称创举，是其组方原则的一大特色，蕴含着极大的临床实用价值，对后世方剂学的发展影响深远。
3．研发药物多种剂型
仲景对药物的应用，采取依病证所需，注重炮制并选择相应的剂型，以取得最佳疗效。如有汤剂、丸剂、散剂、酒剂、含咽剂、煎膏剂、醋剂、洗剂、浴剂、熏洗剂、外用散剂、肛门栓剂、灌肠剂等。上述仲景用药剂型的丰富经验，经实验证明，皆为行之有效的方法，至今仍为医药界所采纳，并取得优良效果，为药物制剂学增添了丰富的内容。