“是药三分毒”不只针对西药，中草药里也有不少有毒成分，如果服用不当也会引发很大的副作用。
炮制不当 炮制是中药临床应用前的加工处理过程，能起到消除或降低药物毒性的作用，如果服用未经炮制的有毒之品，如半夏、附子等，即会产生强烈的不良反应。
剂量过大 如临床上用于治疗水肿、痰饮喘满、食滞虫积的牵牛子，服用15克以上即会出现腹泻、呕吐，其毒素还可影响肾脏，引起血尿，中毒严重者由于神经系统受损，可导致昏迷甚至死亡。
服用方法不对 有些药物因对人体有毒副作用，所以对服用方法有特殊要求，如内服鸦胆子时，必须去壳用胶囊包裹后服用，否则会出现蚀灼口腔、食道、胃黏膜而出血。
配伍不当 一些药物本身并无毒，但使用时若违反配伍禁忌，也会引起不良反应发生，如甘草不宜与海藻同用，丁香不宜与广郁金同用等。
误服药物 因商路外观和人参极为相似，容易被误服。而商陆毒素对交感神经有刺激作用，服用后会出现发热、呕吐、血压升高、心律失常、大小便失禁等不良反应，严重时可导致呼吸抑制、心肌麻痹而死亡。
过敏体质 中药成分比较复杂，当一些药物的化学成分作为抗原或半抗原物质进入人体后，可激发免疫系统产生特异性抗体或致敏淋巴细胞，过敏体质的病人一旦服用后，就会引起过敏反应，出现发热、气喘、胸闷、呕吐泄泻、皮肤瘙痒、皮疹等全身不适反应。临床上较易引起过敏反应的药物有：天花粉、穿心莲、天冬、大青叶、大黄等。
错误辨证 由黄连、黄柏、黄芩等组成的“三黄汤”有清热泻火、燥湿解毒的功效，凡湿热、实火郁结之症皆可应用，但属脾胃虚寒、呕吐泄泻者服之，无疑雪上加霜，导致不良反应的发生。