中医有“祝由”和“祝由科”。“祝由”一词出自《素问·移精变气论》，云：“黄帝问曰：余闻古之治病，惟移精变气，可祝由而已。”句中的“祝由”一词，古今学者都有注解，但大都误释。如唐·王冰注：“祝由：祝说病由。”明·吴昆注：“祝由：祝说其病由也。”后来无论是《内经》的各种注本，还是中医教材及中医字典、词典，甚至《辞源》等工具书，也大都依从王冰的这一注释。“祝由”是“祝说病由”似乎已成定论。
祝由即“断绝患病的根由”
笔者认为，《素问·移精变气论》中的“祝由”并非是“祝说病由”。因为如按此理解，同上下文的含义相违背。因上文谈的是古代的医生治病通过“移精变气”后，可以用“祝由”的方法把病治愈。试想，如按“祝说病由”的方法，是不可能把病治愈的。因为面对病人，医生无论怎样祝说叙述病由，疾病是不能痊愈的。
那么，“祝由”是何义呢？“祝由”的“祝”当是“断绝”之义，“由”是“根由”、“原因”之义。“祝由”即“断绝患病的根由”，这一点可以通过大量的训诂材料得到证明。《广雅·释诂》：“祝，断也。”《正字通·示部》：“祝，断绝也。”《公羊传·哀公十四年》：“子路死，子曰：噫，天祝予！”汉·何休注：“祝，断也。”《列子·汤问篇》：“南国之人，祝发而裸。”晋·张湛注：“祝者，断截其发也。”《谷梁传·哀公十三年》：“吴，夷狄之国也，祝发文身。”晋·范宁注：“祝，断也。”可知“祝”有“断”义。“由”是“根由”、“原因”之义，古今汉语都有此义。《集韵·尤韵》：“由，因也。”《汉语大字典》：“由，原因，缘由。”从以上大量的训诂材料来看，“祝”有“断绝”之义，“由”是“根由”之义。“祝由”就是“断绝患病的根由。”
另外，从《素问·移精变气论》的全文来看，若依此训释，也文从字顺。上古之世，人们“内无眷慕之累，外无伸官之形，此恬憺之世，邪不能深入”，“故可祝由而已。”而到了后世，“忧患缘其内，苦形伤其外，又失四时之从，逆寒暑之宜，贼风数至，虚邪朝夕，内至五脏骨髓，外伤空窍肌肤；所以小病必甚，大病必死，故祝由不能已也。”从本段文字可见，在上古那恬淡的时代，只用“断绝患病的根由”的方法就能治愈。而到了后世，各种病邪侵入人体，只用“断绝患病的根由”方法就不能治愈了。
其实，“祝由”是“断绝患病的根由”这一含义，古代学者已有论述。元代学者陈栎在《素问祝由辨》中云：“《书·泰誓篇》曰：祝降时丧。孔氏注：祝，断也。今以祝训断，谓但断绝其受病之由。正与上文移精变气相照应，转移自己的精神，变改其所感受阴阳风雨晦明之六气，而断绝其受病之由，则其病自已。如病由于寒，则断其寒而暖之，病由于热，则断其热而凉之。祝断其由，如所谓拔其本塞其源，意义岂不显然明白乎。”本断文字非常清楚地指明“祝由”的方法，即“断绝其受病之由”。这一方法是从根本上“拔其本塞其源”的方法。实际上古今许多治病的方法都是采用“祝由”的方法，也就是说从根本上“断绝患病的根由”的治疗方法。
因此，“祝由”并不是“祝说病由”，而是“断绝患病的根由”，这才是其真实含义。
“祝由科”的“祝由”即“诅咒”
那么，“祝由科”是何义呢？“祝由科”是古代医疗机构中的一科。那么，古代的“祝由科”是用什么方法治病？古今学者做了大量的研究，笔者查阅了一下，发现有几十篇文章之多。但大都认为“祝由科”是“精神疗法”、“心理暗示”“对天祷告”等等，如《辞源》“祝由科”云：“有疾病者，对天祝告其由，故名曰祝由科。”这些观点，好像已成定论。笔者通过研究发现，之所以有各种错误的理解，是因为不明白“祝由”二字的含义所致。名不正，则言不顺。所以，辨析“祝由”二字的含义，是正确理解“祝由科”的前提。
“祝由科”的“祝”当通“咒”，古音“祝”“咒”音同，均为“章”母“觉”部，故可通假。这一点许多工具书大都收入，如唐·玄应《一切经音义》卷六：“祝，《说文》作詶。詶，诅也。今作咒。”《集韵·宥韵》：“祝，诅也。亦作詶。”《汉语大字典》：“祝，诅咒。”
另外，还可通过前人的训释得到证明：《诗经·荡》：“侯作侯祝。”汉·毛亨传：“祝，诅也。”宋·朱熹《诗集传》：“祝，音呪。”《礼记·郊特牲》：“诏祝于室。”唐·孔颖达疏：“祝，咒也。”《新序·杂事》：“一祝不胜万诅。”句中“祝”“诅”异文同义。《汉书·元后传》：“更祝诅杀我，太子怜之。”句中“祝诅”同义连用。
这一点清代几位训诂学家也已指出，如《说文解字·言部》：“詶，诅也。”清·段玉裁《说文解字注》：“祝，今作呪，《说文》作詶。经典通作祝不用詶。”清·桂馥《说文解字义证》：“詶，经典通作祝。《书·无逸》：否则厥口诅祝，俗作咒。《广韵》咒，诅也。”
可见，“祝由科”的“祝”通“咒”。那么，“由”是何义呢？“由”当通“礻由 ”或“礻留 ”，《说文解字·示部》：“礻留，祝礻留 也。”清·段玉裁《说文解字注》：“祝由，即祝礻留 也。”清·朱骏声《说文通训定声·孚部》：“礻留 ，祝礻留 也，从示留声，字亦作礻由 。”那么，“礻由 ”是何义呢？《说文解字·言部》：“礻由 ，詶也。”段玉裁注：“祝礻留 字亦作礻由 ，盖与讠由 一字也。”可知，“祝由”的“由“也写作“礻由 ”，“讠由 ”、“礻留 ”，其义相同。
由此可知，“祝由科”的“祝由”是“诅咒”之义。“祝由科”即“诅咒科”，也就是说用诅咒的方法治疗疾病。诅咒就是说最不好听的话，咒语是具有攻击性，驱散性的。祝由医师发出的咒语，可以干扰病人的大脑，大脑就易于失控。所以说咒语威力是相当大的，是最神秘的。祝由医师要用咒语诅咒病魔，将病魔赶出人体。
“祝由科”是用“诅咒”
之术驱病的方法
按《历代职官表》所载，“祝由”治病的方法在周代至唐代以前的官方医疗机构中都没有被提到，但是在唐代的“太医署”中却是四大科之一，只不过名字叫作“咒禁”，唐代的“太医署”既是医学教育机构，又是医疗单位，在编制上分为四科：医科、针科、按摩科、咒禁科。从唐代以后到明代以前，“祝由”或“咒禁”的名称又不见于官方记载了。明代的最高医疗管理和教育机构是“太医院”。太医院中设有十三科：大方脉、小方脉、妇人、疮疡、针灸、眼、口齿、接骨、伤寒、咽喉、金镞、按摩、祝由。一方面，祝由治病的方法又重新得到了官方最高医疗机构的承认和扶持；另一方面，祝由科已经是十三科之末了，因此有“祝由十三科”之称。到了清初，太医院的科别设置减为十一科，祝由科被排斥出了太医院。清代名医徐大椿《医学源流论·卷下·祝由科论》说：“(祝由)古法今已不传。近所传符咒之术，间有小效，而病之大者，全不见功。”
用“诅咒”之法治病，在古书中多有记载。如《抱朴子·至理篇》：“吴越有禁咒之法，甚有明验……知之者可以入大疫之中，与病人同床而己不染。”又《说苑·辨物》：“吾闻古之医者曰苗父，苗父之为医也，以荐为席，以刍为狗，北面而祝，发十言耳，诸扶而来者，舆而来者，皆平复如故。”《韩诗外传汉·韩婴·卷十》：“扁鹊过虢侯，世子暴病而死。扁鹊造宫，曰：‘吾闻国中卒有壤土之事，得无有急乎？’曰：‘世子暴病而死。’扁鹊曰：‘入言郑医秦越人能治之。’庶子之好方者出应之，曰：‘吾闻上古医者曰茅父，茅父之为医也，以莞为席，以刍为狗，北面而祝之，发十言耳，诸扶舆而来者，皆平复如故。子之方岂能若是乎？’”至于诅咒时的咒语，古书多有记载，如《黄帝祝由十三科》一书，就详细记载了各种咒语，兹不赘述。
可见，今人所谓古代的“祝由科”是“精神疗法”、“心理暗示”、“对天祷告”等等，多是不确切的。“祝由科”实际是用“诅咒”之术驱病的方法，这才是正确的训释。