有些药物有损害牙齿和牙周健康的副作用，患者在服用时应引起注意。这些药物有：
四环素类药物伤牙齿。四环素类抗生素，包括四环素、土霉素、金霉素和地美环素等，对牙齿中的钙化组织有较强的亲和力，形成稳定的螯合物，导致牙釉质发育不全，牙齿呈灰暗色或灰黑色。建议孕妇、哺乳期妇女以及小于8岁的儿童禁用此类抗生素。
三类药物伤牙龈。牙龈增生是一种特发的炎性反应，病损可累及全口牙龈，以上下前牙区较重。造成这类损害的药物主要有三类：抗癫痫药如苯妥英钠，长期服用容易引起牙龈增生，且多见于儿童和青年患者，类似的药物还有苯巴比妥、扑米酮等；免疫抑制剂如环孢素，多用于器官移植的病人，也可能损伤牙龈；钙通道阻滞剂类降压药如硝苯地平、尼群地平、氨氯地平、维拉帕米等，连用两个月即可发生牙龈增生。正在服药的病人，应加强口腔清洁和保健，不要刺激损伤牙龈组织，预防牙周病。
伤口腔黏膜的药物。除了牙齿和牙龈，还有些药物会伤害口腔黏膜。常见的包括抗肿瘤药物，如甲氨蝶呤、琉唑嘌呤、多柔吡星等；抗生素类，如头孢唑林、磺胺类、异烟肼等；激素类药物等。使用上述药物时，如果出现口腔黏膜损害，要及时停药、换药或减少药量，尽快对黏膜进行对症处理。