药酒在我国有着悠久的制作历史。我国最早的药酒酿制方，是在1973年马王堆出土的帛书《养生方》和《杂疗方》中。
从《养生方》的现存文字中，可以辨识的药酒方共有六个：其中两个为，1、用麦冬（即颠棘）配合秫米等酿制的药酒（原题：“以颠棘为浆方”治“老不起”）；2、用黍米、稻米等制成的药酒（“为醴方”治“老不起”）。比较完整的是第二个。该方包括了整个药酒制作过程、功能主治等内容，是酿制药酒工艺的最早的完整记载。
先秦时期，中医的发展有了长足进步。这一时期的医学代表著作《黄帝内经》，对酒在医学上的作用，做过专题论述。在《素问·汤液醪醴论》中，首先讲述醪醴的制作“必以稻米、炊之稻薪、稻米者完、稻薪者坚”，其中醪是浊酒，醴是甜酒。
到了东汉，医学家张仲景在其著作中多次论述了药酒与药的关系。从隋唐至宋元明清，尤其是蒸馏酿酒的出现，药酒的发展进入了一个崭新的阶段。唐代孙思邈《千金方》和《千金翼方》中载有巴戟天酒、五加酒、枸杞酒、虎骨酒等十余种。
在现代，尽管各种剂型的酒类琳琅满目，但是古老药酒仍然与时代共存。到了冬季，人们喜欢用药酒补身子，足以说明药酒的经久不衰。