M胆碱能受体阻滞剂如阿托品、东莨菪碱、山莨菪碱、樟柳碱等均属于莨菪类药物，临床一般用于感染性休克、胃肠绞痛、眩晕、突发性耳聋、有机磷酸酯类农药中毒的救治等。近年来，这些药物的临床应用范围不断拓宽，尤其是对神经系统疾病显示了良好的治疗作用，现介绍如下。
偏头痛：取莨菪浸膏片20-30毫克，口服每日3次，2周为1疗程，一般2～4个疗程。亦可取山莨菪碱10毫克，复方丹参液20毫升加入5％的葡萄糖中，每日1次静脉滴注，7天后改山莨菪碱5毫克，复方丹参片4片，口服，每日3次，1月为1疗程。此病发作时，既有血管扩张，又有血管痉挛。而山莨菪碱对脑血管具有双向调节作用，即当血管处于收缩相时可使血管调节于扩张相；而处于扩张相时可使血管调节于收缩相。这种调节可能是通过自主神经(交感和副交感神经)来实现的。
蛛网膜下腔出血后脑血管痉挛：对于此病给予山莨菪碱首剂40毫克静脉推注，以后40毫克每日3次，重复用药3~5天。病情稳定后改为肌注10~20毫克，每日3次，巩固数天停药。山莨菪碱能有效地解除血管痉挛，疏通微循环，调节和促进微血管的自律运动，改善脑缺血缺氧。
糖尿病性周围神经病：山莨菪碱每日80-100毫克，4周为1疗程。山莨菪碱改善微循环不只是单纯扩张血管，而是在多环节多部位上改善血液流态，同时调节微血管口径，解除血管痉挛，减轻毛细血管内皮细胞损伤，保护生物膜。
运动神经元疾病：大剂量莨菪浸膏片48—160毫克，每日3次口服，治疗肌萎缩侧索硬化症，可使肌力显著增加或完全恢复正常。这类患者治疗前检查甲皱微循环多发现有异常，而此类药物能有效改善微循环。
癫痫：开始取东莨菪碱0．3毫克，山莨菪碱10毫克静脉滴注(小儿患者东莨菪碱每千克体重0．03毫克，山莨菪碱1-2毫克)，逐日递增剂量至莨菪化(极度扩张外周血管)后，用药15-20天，以后改为口服维持。此类药物能改善微循环，使处于变性和供血不足及代谢失常且具有过度兴奋性的细胞改善供血，提高脑组织的血氧供给，抑制或减少脑细胞异常放电而达到治疗癫痫的目的。