苗族对疾病的预防很讲究，早在秦汉时期，苗族先民就有用菖蒲、艾叶、雄黄、朱砂辟邪防病的习惯。如每年端午，苗家门上都要挂菖蒲、艾叶，用于辟邪；用雄黄酒、朱砂粉洒房间内外，以防虫兽；苗民还择时节，用苗药煎水内服，预防时宜疾病。
在苗家山寨还有种“风水林”的习惯。苗家人认为，人之所以生病，是因为荒郊野外的各种精灵作祟，为了保护村寨安全，每个苗寨都要集体维护该村寨的风水林和茅草地。苗族用神化的观念来维护村寨的生态坏境，不仅维护了苗山的生物多样性，其实也是预防疾病的重要措施之一。
除此之外，凤凰县苗乡人民为保证饮水清洁，常把井建成“三连井”，以分开饮用水、洗菜水和洗衣水。黔东北苗族人在“接龙节”、“十月苗节”、“三月三”、“跳花节”等苗族节日，无论大人、小孩都要口含当地的一种苗药——苦藤，以预防风湿病。
夏天走长路、上山劳动，带点大蒜子、百味连、盐巴之类，以防中暑；冬天吃些生姜、辣椒、花椒之类，以防感冒；秋冬不在露天休息，以防感染伤寒；春夏注意饮食卫生，以防疟疾、痢疾等都是苗民在预防疾病方面的经验。另外，苗家人的苗拳、苗功对增强体质、预防疾病、健康长寿也起到了重要作用。