回族医药作为中国民族医药大家庭的一员，在某些理论、学科、药物、炮制方法、民间疗法、验方、体疗、食疗及卫生保健方面，回族医药都具有较鲜明的民族特色，在漫长的历史进程中，扮演了重要的角色，为回族聚居区乃至全国各族人民的卫生保健发挥过积极的作用。它的产生、演变与传承，是东、西方医药文化相互交流、融合的结果，是东西合壁的结晶，但更重要的，是与中国本土医药理论、实践交融的成果。
回族医药，起源于阿拉伯伊斯兰医药实践。阿拉伯伊斯兰医药是随着阿拉伯帝国的崛起和扩张而逐渐发展、壮大的，它在阿拉伯半岛医学遗产的基础上，吸收了古希腊“四元素说”、“四察性说”、“四体液说”等哲学原理和医术理论，也容纳了古波斯、印度等地的医药知识。
在阿拉伯国家与中国建立友好往来的过程中，阿拉伯伊斯兰医药学与中国本土医药理论与实践也经历着相借鉴、融合的过程，形成了具有浓郁中国特色的伊斯兰哲学，认为世界是物质的，且是运动的，变化的，在此基础上，以元气发露，两仪阴阳，阴阳化而生四元，四元相互作用而生金、木、活三子，四元三子共同作用而生万物，这从理论上指导着回族医药的实践。
因此，回族医药是以伊斯兰哲学与中国传统哲学思想为指导，吸收融汇东西方医学的理论体系与临床实践经验等医学精华；以真一、元气、阴阳七行等为理论基础，阐述和探讨人体生理病理现象，提供防治疾病的知识，指导穆斯林生活习俗、养生保健和医药卫生为主要内容的医学体系，是中国民族医药的一朵奇葩。