按生物分类学标准，分类应能反映生物体的进化与种系发生的关系。但病毒不可能按这个原则分类，一般仍按病毒鉴定等的实际需要而分类。
各种生物体均可有病毒寄生。已知有动物病毒、植物病毒、放线菌病毒及细菌病毒（即噬菌体）。医学上重要的病毒有500种左右，其中有不少对人类有致病力。有些病毒也能在节肢动物中增殖（如虫媒病毒）。目前通过的分类法是将支物病毒分为脱氧核糖病毒(Deoxyriboviruses 简称DNA病毒)与核糖核酸病毒(Riboviruses 简称RNA病毒 )两大类。再按病毒的理化性状分为若干科（族属）（表21-2）。
表21-2 按病毒理化及生物性状的分类（供参考）
| 核心中的核酸 | 衣壳的对称性 | 囊膜 | 对乙醚敏感性 | 壳微粒数 目 | 病毒体大小(nm③) | 核酸分子量(×106) | 核酸物理学形式 | 基因数（约数） | 病毒科名 |
| DNA病毒 | 20面体 对 称 | - | 不敏感 | 32 72 252 | 18～26 45～55 70～90 | 1.5～1.8 3～5 20～30 | 单 股 双股环状 双 股 | 3～4 5～8 30 | 小DNA病毒科(Parvoviridee) 乳头多瘤空泡病毒科(Papovaviridae) 腺病毒科(Adenoviridae) |
| + | 敏感 | 162 ? | 100④ 42 | 90～130 2.1 | 双 股 环状双股 | 160 7 | 疱疹病毒科(Herpetoviridae) 嗜肝病毒科(Hepadnaviridae) | ||
| 复合 对称 | 复合外壳 | ① | 230～300 | 130～240 | 双 股 | 300 | 痘病毒科(Poxviridae) | ||
| RNA病毒 | 20面体对称 | - | 不敏感 | 32 ?② | 20～30 60～80 | 2～2.8 12～19 | 单 股 双股分段 | 4～6 10～12 | 小核糖核酸病毒科(Picornaviridae) 吸肠弧病毒科(Reoviridae) |
| + | 敏感 | 32 | 40～70 40～50 | 3～4 3～4 | 单 股 单 股 | 10 10 | 披膜病毒科(Togaviridae) 黄病毒科(Flaviviridae) | ||
| 螺旋对称 | + | 敏感 | 90～100 80～120 150～300 70～175 | 6～15 5 5～8 3～4 | 单股分段 单股分段 单 股 单 股 | 23 10 >10 5 | 布尼安病毒科(Bunyaviridae) 正粘病毒科(Orthomyxoviridae) 副粘病毒科(Paramyxoviridae) 弹状病毒科(Rhabdoviridae) | ||
| 不明或复合对称 | + | 敏感 | 50～300 80～130 ～100 | 3～5 9 7～10 | 单股分段 单 股 单股双倍 | 10 30 20～30 | 沙粒状病毒科(Arenaviridae) 冠状病毒科(Coronaviridae) 逆转录病毒科(Retroviridae) |
说明:①正痘病毒(Orthopoxvirus)包括天花、类天花、牛痘、牛痘苗、兔痘、猴痘及鼠脱脚病等病毒皆对乙醚有抵抗性，而其他的痘病毒则对乙醚敏感。
②呼肠病毒(Reovirus)有一个外衣壳和一个内衣壳。内壳有32个壳微粒，外衣壳的壳微粒数目则未确定，认为总共有92个壳微粒。
③病毒体大小是指直径或直径×长度。
④脱去囊膜的裸露病毒体，其核衣壳的直径为100nm，但有囊膜的病毒体则可大至200nm。